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Idesia (Arica)

versão On-line ISSN 0718-3429

Resumo

OLIVEIRA DA SILVA, Fernanda; TERUMI ITAKO, Adriana  e  TOLENTINO JUNIOR, Joao Batista. Evaluación del crecimiento del micelio mediante análisis de imagen digital en R. Idesia [online]. 2017, vol.35, n.1, pp.7-10.  Epub 21-Mar-2017. ISSN 0718-3429.  http://dx.doi.org/10.4067/S0718-34292017005000001.

Este estudio tuvo como objetivo el desarrollo de un script en R para evaluar el crecimiento de hongos en placas de Petri utilizando la visión por ordenador. El script fue desarrollado para ayudar a los estudios de fitopatología agrícola. Los hongos utilizados fueron Elsinoe ampelina, Fusarium oxysporum y Fusarium verticillioides. Las imágenes se analizaron a continuación con R y EBImage. La función computeFeatures.shape se utilizó para calcular el área y el diámetro medio de la colonia y de la etiqueta en píxeles cuadrados. La secuencia de comandos se ejecuta en un bucle para automatizar el análisis de todas las imágenes en secuencia. El script desarrollado en R con EBImage era capaz de reconocer y medir las colonias de hongos examinadas. Simultáneamente a fotografiar, el diámetro medio de las colonias se obtuvo mediante el cálculo de la media aritmética del diámetro medido con dos líneas perpendiculares rectas utilizando una regla. Utilizando el diámetro medio, el área de la colonia se calculó como un círculo. El coeficiente de determinación y el error cuadrado medio de la raíz se calcularon utilizando las medidas y los valores obtenidos con el programa. Con base en el coeficiente de determinación, las mediciones obtenidas con el software son similares a las realizadas utilizando una regla. La secuencia de comandos reduce el tiempo de análisis de imágenes y aumenta la precisión, especialmente para colonias no uniformes.

Palavras-chave : software; visión por computador; EBImage; crecimiento del micélio.

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